Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx10Q9CWT3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx10Q9CWT3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx10Q9CWT3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx10Q9CWT3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Snx10Q9CWT3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Snx10Q9CWT3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Snx10Q9CWT3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx10Q9CWT3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms