Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms