Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Tm4sf20Q9CQY8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Tm4sf20Q9CQY8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Tm4sf20Q9CQY8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Tm4sf20Q9CQY8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Tm4sf20Q9CQY8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Tm4sf20Q9CQY8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Tm4sf20Q9CQY8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tm4sf20Q9CQY8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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