Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms