Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ykt6Q9CQW1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms