Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU0

Txndc12, Thioredoxin domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc12Q9CQU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc12Q9CQU0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Txndc12Q9CQU0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms