Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ8

Lsm7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm7Q9CQQ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm7Q9CQQ8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms