Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl35Q9CQL6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl35Q9CQL6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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