Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed6Q9CQG0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms