Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rab5aQ9CQD1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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