Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpa3Q9CQ71 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms