Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms