Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms