Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CPS8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPS8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms