Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce3Q9CPR8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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