Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rpl17Q9CPR4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms