Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrbp1Q99PL5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrbp1Q99PL5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms