Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930550L24RikQ99PA7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930550L24RikQ99PA7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms