Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2ird2Q99NI3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms