Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms