Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms