Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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