Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms