Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q99KU6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99KU6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99KU6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q99KU6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms