Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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