Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dok4Q99KE3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms