Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms