Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrabdQ99JY4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms