Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf11Q99JX1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms