Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms