Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cdk9Q99J95 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cdk9Q99J95 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cdk9Q99J95 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk9Q99J95 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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