Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms