Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip1Q922J3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms