Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms