Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms