Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atpaf2Q91YY4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atpaf2Q91YY4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms