Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms