Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps36Q91XD6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms