Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms