Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx9Q91VH2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms