Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BsndQ8VIM4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms