Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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