Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk4Q8VEJ3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms