Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1aQ8VDS4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rprd1aQ8VDS4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms