Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TgdsQ8VDR7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms