Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms