Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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