Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajc28Q8VCE1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms