Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms