Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms